我叫（jiào）阿虛，就讀縣立北高中一年五班，每天過著（zhe）簡單平凡（fán）的（de）生（shēng）活（huó）；但（dàn）自從（cóng）遇上涼宮春日以後整個世界（jiè）都變了；還記得開學第一天，她自（zì）我介紹說：“我對普通人類沒有興趣，你（nǐ）們之中要（yào）是有外星人、未來人、異世（shì）界（jiè）人、超能力者，就盡管來找我吧！”
本來一見涼宮這般的超級美女便甚有好感，可是聽到她（tā）不知是否笑話的（de）介紹便（biàn）嚇倒，而曾與她國中同班的穀口更警告我別對她妄想，之後提及班中的大美女朝倉涼子：她時（shí）常散發微（wēi）笑的俏麗臉龐，使人看到如浴春風，個性溫柔體（tǐ）貼、為人熱（rè）心、頭腦聰穎，不隻男生，連女生也多崇拜她；穀口把所有一年級的女生分a至d級（jí），涼宮（gōng）屬a級美女，朝倉更是＋級，說她是全高中一年級中最（zuì）漂亮的女生（shēng），相（xiàng）信其她女生也不會（huì）反對。
開學後涼宮便被孤立，隻有女班長朝倉間（jiān）中與她交談，可是她卻無視（shì）；然而春日不單成績優異，運動甚至（zhì）比許多男生更強！
曾參與校內（nèi）所有學會，皆有使人觸目（mù）表現，卻對所有學會無興（xìng）趣；在班房（fáng）內無視所有男生存在，便脫下水手（shǒu）服外衣，隻餘胸罩換運動服，種（zhǒng）種怪行成校內焦點。
但（dàn）不知是否命運安（ān）排？
不（bú）久我便成為班內唯一常與涼宮對話的人（rén），更幫她建立s團（讓世界變得更熱鬧（nào）的（de）涼（liáng）宮春日團）。
團內成員包括本應屬文藝（yì）部的長門有希，她同是一年級卻不同班，被穀口評為a－級，平日總是麵無表情在看書（shū）的（de）眼鏡娘，校內卻有許多隱性的愛慕者，不知是否因為她像中淩波麗的關係？
但某晚竟約我到她家中，說自己（jǐ）是統治銀河係的信（xìn）息統合思念體之人（rén）形對人（rén）用接口，簡單來說即外星人造人（rén），負責觀察涼宮春日，因為思念體認為她擁有不自（zì）知的神（shén）奇能力，具備自我進化的可能（néng）。
外表隻像初中（zhōng）生（shēng）的朝（cháo）比奈實玖（jiǔ）瑠，其實卻是比（bǐ）我們大（dà）的二年級學姐，因為樣子蘿莉（lì）卻擁有巨乳，被涼宮說是很萌（méng）的（de）吉祥物而強迫加入s團，相信她是全校最漂亮的女生；曾被涼宮強迫穿（chuān）兔女郎裝在校門派傳單，而轟動全校，目前在團內被迫成為女傭；一（yī）次與她外出（chū），竟說自己是未來的調查員（yuán），因未來發現涼宮春日三年（nián）前（qián）曾使時間出現不明斷層！
最後一位團員叫古泉一樹，新來（lái）的男性轉校生，被涼宮指是謎之轉校生，給人狐狸般的狡猾感覺（jiào）；自稱是超能力機關中的一員，而機關高（gāo）層更認為涼宮是創造現（xiàn）世（shì）界的神！